有多余物品时，玩家可以通过升级背包容量和制作存储容器来扩大存储空间。初始背包的格数有限，玩家可以前往位于鹈鹕镇的皮埃尔杂货店，在收银台处支付金币来升级背包，每次升级可以增加12个格子。玩家可以自行制作储物箱，每个箱子提供36格的独立存储空间，可以根据需要在农场、房屋内或马厩附近放置，用以分类存放暂时不使用的物品、工具或季节性资源。
将多余物品出售是将其转化为金币的有效途径。玩家可以前往游戏中的各类商店，如鹈鹕镇的普通商店、探险家公会或特定功能店铺，在交易界面中选择背包内希望出售的物品来完成交易。另一种便捷的方式是将物品直接放入农场门口的出货箱中，系统会在次日结算并自动将金币存入玩家的账户。对于多余的工具和武器，部分可以在升级时以旧换新，而旧鱼竿、戒指、鞋子或武器可以选择出售给特定商人或存放在衣柜中。
通过加工将多余原材料转化为价值更高的工匠产品是更高效的处理方式。玩家可以建造小桶，将水果放入酿造成果酒，或将蔬菜酿造成果汁，其售价比原始材料更高。酿酒桶可以将小麦加工为啤酒，将啤酒花加工为淡啤酒。蜂蜜可以制成蜂蜜酒，茶叶可以制成绿茶。使用熔炉可以冶炼矿石获得金属锭。这不仅能清理背包空间，还能最大化物品的经济收益。
建立有序的存储系统并进行分类整理能极大提升管理效率。玩家可以在房屋升级后，购买工作台并配合多个储物箱来创建分区存储系统。工作台能自动从周围八个普通箱子中提取材料用于制作。建议按区域分类，例如设立工作区存放矿石、木材等基础材料；设立宝箱区按季节存放农作物、水果和加工品；设立专门区域存放鱼类、花卉、武器装备或待回收的物品。使用文字标牌对不同箱子进行标注可以避免混淆，方便快速查找。
定期清理和舍弃不必要的物品是维持系统高效的关键。对于确定无用的物品，玩家可以直接将其丢弃，在菜单中选择物品后将其拖至垃圾箱图标处即可永久删除。需要某些物品可能对未来的任务、献祭或送礼有潜在价值，在处理前应谨慎判断。对于食物类物品，需留意其保鲜期限，避免变质造成浪费。通过持续整理和优化存储系统，可以确保农场的运营井然有序。
