挖矿完成后系统会根据你的采集速度和科技等级扣除一定比例的宝石作为手续费，这部分扣除通常不会超过总量的10%，但具体比例会根据你的科技研发程度和联盟加成有所浮动。提前点满采集科技能有效减少扣除比例，建议优先升级经济科技中的珠宝技术，这项科技直接影响宝石采集效率和扣除比例。
如果你在挖矿过程中使用了采集加速道具，系统会在结算时额外扣除少量加速时间作为损耗，这部分扣除通常不会影响整体收益。记得在挖矿前检查自己的负重上限，如果采集量超过负重上限，超出的部分会被系统直接扣除，所以尽量派出高负重的攻城车队伍进行采集。
联盟领地内的资源矿采集完成后不会被扣除，但在非联盟领地采集宝石矿时，系统会根据你的联盟科技和领地范围扣除少量资源作为运输损耗。如果你的联盟已经研发了相关运输科技，这部分扣除可以降到最低。另外在KVK活动期间采集宝石矿，系统会暂时免除所有扣除，这是囤积宝石的最佳时机。
挖矿过程中如果触发了满载而归符文，结算时系统会免除当次采集的所有扣除，所以看到这种符文一定要优先采集。符文消失后采集速度会恢复正常，但不会影响已经免除的扣除比例。注意不要在采集中途更换队伍或撤回，这样会导致系统重新计算扣除比例，可能造成不必要的损失。
挖矿完成后记得及时将宝石存入仓库，长时间留在背包中可能会被系统判定为闲置资源并扣除少量保管费。仓库容量不足时也会触发额外扣除，建议提前升级仓库等级或使用资源保护道具来避免这种情况。
